在日常生活中，我们常常会遇到各种各样的房产登记问题。其中，关于房产证上份额分配的问题，比如99%和1%的情况，就比较特殊了。那么，当房产证上的份额比例为99%和1%时，我们应该如何办理呢？本文将从多个角度为大家详细解答这一问题。

首先，我们需要明确的是，房产证上的份额比例是根据房屋产权人之间的协议来确定的。在实际操作中，99%和1%的份额比例通常是家庭成员之间的一种约定，比如父母和子女之间的财产分配，或者是夫妻双方对房产的不同出资比例等。因此，在办理此类份额分配时，首先要确保所有产权人都同意并签署了相关的协议文件。

接下来，具体的办理流程可以分为以下几个步骤：

1. 签订书面协议：产权人需要共同签署一份详细的份额分配协议书，明确各自所占的份额比例以及相关权利义务。这份协议书应当包含双方的身份信息、房产的具体位置及面积、份额比例等内容，并且最好由律师审核或公证处进行公证，以保证其法律效力。

2. 申请变更登记：准备好上述协议书后，产权人需携带身份证件、房产证原件以及其他必要材料前往当地不动产登记中心提出变更登记申请。工作人员会对提交的资料进行审核，确认无误后才会受理。

3. 缴纳费用：根据国家规定，办理房产份额变更登记可能会产生一定的手续费，具体金额视地区而定。申请人需按照要求及时缴纳相应费用。

4. 领取新证：完成上述步骤之后，等待一段时间（通常为几个工作日），就可以拿到更新后的房产证书了。此时，房产证上就会清楚地显示每位产权人的具体份额比例。

需要注意的是，在整个过程中，如果涉及到未成年人作为共有人之一，则必须遵循《民法典》等相关法律法规的规定，采取适当措施保护未成年人的利益；同时，对于非直系亲属之间的房产份额转让行为，还可能受到限购政策的影响，因此建议提前咨询专业人士获取专业意见。

总之，面对房产证上99%与1%份额这样特殊的分配情况时，只要按照正规程序一步步来操作即可顺利完成办理。希望本文能够帮助到大家解决相关疑问！